正当他们一筹莫展之时，持有斩魂刀“弥勒丸”的死神少女茜雫突然出现，并成功驱散欠魂。露琪亚对一连串的事件颇感不安，于是回到尸魂界调查。从护廷十三队的口中，一护得知现世和尸魂界中间的断界出现新的空间，并且不断膨胀，导致现世与尸魂界相通。这一切并非自然形成，似乎有人正暗中操纵着一切，而茜雫正是这起事件的关键…… 本片根据日本漫画家久保带人的同名原著改编，系该动画的第一部剧场版。
那个女孩钻穿了天花板，从二楼掉了下来！？住在破旧的公寓里，我唯一感到治愈的是二楼漂亮的房东和可爱的女孩。有一天，天花板发出吱吱作响的声音。。。“砰！”爆炸了，二楼的女孩从我正上方的天空坠落！？通过奇迹般的桃色事件，心脏和身体意外地连接在一起。
由于长距离子空间导航造成的时间和空间扭曲，导致人类返回的地方在20000年后变成了“地球””。在这个地球上，主人公庆南等人在被哥斯拉攻击的同时，与埃切弗族和比尔沙尔德族的外星人一起，实施了20年的“对抗哥斯拉的战术”，并通过一场致命的战斗成功击败了哥斯拉。但喜悦并没有持续太久。真正的哥斯拉“哥斯拉地球“隐藏在地下深处的东西出现了。在长达2万年的持续生长和生存过程中，青南和其他人在哥斯拉压倒性的破坏力面前分崩离析，哥斯拉进化成了这种姿态。拯救青南的人被认为是人类的残余，即米亚纳的富图阿人。富图阿是他们在地球上遇到的第一个人类。他们会是人类的后代吗。“福图亚之神也被哥斯拉打败了，现在只剩下鸡蛋了。挑战者和抗议者都被火焰吞噬了，消失了。”面对他们，庆南回答说，“这是用人手夺回地球的最后机会。”，注意到Fortuya使用的箭头是由“对金属体和纳米的自律思考”制成的，他很高兴。这是由与“机械哥斯拉”相同的材料组成的，他们在21世纪在富士山脚下开发了“对抗哥斯拉的决定性武器”，并在启动前被摧毁。这恰恰证明了当时的开发设备在今天仍然存在。
