在参拜母亲坟墓的回程中,真嗣(绪方惠美配音)和川上隆(宫村洋子配音)遭到了第七使徒的袭击。在关键时刻,第二架飞机被强大的力量击败,真嗣也遇到了第二架机器的操作员Shibo Akira Langley(由宫村洋子配音)。孤单伫立于京都寺町三条商店街的古董店“藏”。 女高中生真城葵偶然地与“藏”店主的儿子家头清贵相识,并开始在“藏”打工。 清贵虽然言行举止很温和,却具备令人恐惧的敏锐直觉,人称“福尔摩斯”。