20世纪中叶，第二次世界大战正处于如火如荼的关键时刻。此时，大不列颠帝国得到一条重要情报，拥有“代理总统”之称的纳粹头目少校（飞田展男 配音）正秘密发动一场扭转战局的重要战争，他所率领的部队据说全由嗜血如命、毫无人性的肉体怪物食尸鬼组成，一旦食尸鬼部队发起攻击，同盟国的优势将荡然无存，世界亦将进入最为黑暗的时刻。针对这一情况，皇家国教骑士团Hellsing宣誓誓死捍卫本土，而当时正青春年少却有着“死神”绰号的沃尔达•C•多内兹（朴璐美 配音）也带着恐怖的吸血鬼阿尔卡特飞抵英国上空，卷入了这场影响深远的世纪战争中。皇家国教骑士团的传奇就此拉开了序幕…… 本片根据平野耕太的原作改编，为《皇家国教骑士团》的外传。
卑鄙的大森正雄（吉田涉也饰演）在服刑后获释。出乎意料的是，他在街角被一名身份不明的人绑架，随后遭到殴打并昏倒。当毛雄再次醒来时，他似乎忘记了自己的名字和过去。
我们的使命， 是击退企图破坏作品世界的【病毒】！ 我们要为了守护这个世界而努力！ 曾经号称御宅文化圣地的秋叶原如今也成为了商业街， 动画和漫画的记忆逐渐被忘却，专卖店也逐渐关闭，变得所剩无几。
