游戏以前作 2 年后的日本乡村小镇“稻羽市”为舞台，玩家将扮演刚转学到稻羽市八十神高中 2 年级的主角，在追查神秘连续杀人事件时，潜在的“PERSONA”能力觉醒，同时也开启了进入异世界的大门，与其他 PERSONA 召唤者一同挑战神秘的迷宫。 游戏承袭前作的基本系统并加以强化，结合校园冒险与迷宫战斗 2 大部分。冒险部分将让玩家体验与形形色色的夥伴结交与互动的过程；战斗部分则让玩家与夥伴组队深入本作全新登场的乱数产生迷宫，发挥各自的 PERSONA 之力对抗异世界的神秘怪物。
Robum和他的家人和朋友生活在一个叫Koakoya的星球上，这个星球富含丰富的浮游生物矿物。邪恶的浮游矿工业公司为了夺取这些矿山，采取了各种卑鄙的手段，试图赶走罗博姆等早期先驱。Robham乘坐的宇宙飞船遭到了漂浮矿石工业的袭击，意外造成混乱，并连接到了Oho的房间。多啦a梦和大和修理了Robum的宇宙飞船，并与Koyakoya的人们成为了好朋友。与此同时，浮游矿行业继续他们的邪恶计划，善良正直的大雄决心帮助外星朋友保卫家园
故事发生在东京八张岛海岸，那里建造了一个名为“太平洋浮标”的海上设施，连接着来自世界各地的警察监控摄像头。在该设施正式启动之前，来自世界各地的IT工程师来到现场，以便与欧洲刑警组织管辖的范围联系。
