Kochi(由Reika Matsumoto配音)来自镇心镇,他的目标是成为神奇宝贝的顶级教练。在他即将踏上训练师之旅的那天,由于迟到,他没有收到最初的精灵。失去阿尔梅多尼亚首都贝恩的王储朱利叶斯为了恢复自己的权利,向《人类宣言》的发起者大凯撒帝国寻求帮助。大凯撒帝国玛丽亚女王的妹妹琼·尤弗里亚代表帝国协助阿米多尼亚进行谈判。不仅仅是阿尔弗雷登和阿米多尼亚,事情的发展方向即将影响整个大陆的命运。