天之川学园高中来了一位理飞机头并穿短袍的奇怪转校生，他的名字是如月弦太朗，有着“和全校同学成为朋友”的远大目标。初到校的弦太朗结识了神秘少年歌星贤吾，并再次遇见青梅竹马城岛有希。 同一时刻，校园里出现了Zodiarts怪人。
柯南、小兰等人理所当然也接到邀请，甚至电视台的人也兴师动众前来。随着时间的流逝，双方的对决悄悄展开。另一方面，恐怖组织红色暹罗猫也登上了飞船。此前不久，红色暹罗猫袭击了国立东京微生物研究所，并盗走一种致命的病毒。 本片根据青山刚昌的同名漫画改编，是该动画的第14部剧场版。
许多年后，爱德华（山田龙之介饰）成长为这个国家最年轻的钢铁炼金术师。他和他的兄弟（水石屋飞梦配音）一起找到了哲学家的石头。与此同时，神秘的人造人Raster（松由康子饰）和Enwei（本真敏雄饰）徘徊在这个国家的角落。他们的规划者的可怕活动，天空有一段时间多云。。。这部电影是根据荒川宏的原创漫画改编的。
