在天气寒冷的札幌,作为一名私家侦探,“我”(杨大全饰演)和他的搭档高田(松田龙宏饰演)在一家安静昏暗的酒吧里度过了无聊的时光。与此同时,当地金融界备受尊敬的总裁福岛敏人(西田敏浩饰演)在晚上回家的路上因营救一名妇女而遇难。
镇心镇的青少年年满10岁后,即可获得训练神奇宝贝的资格。一个名叫Kochi(松本丽香配音)的10岁男孩,以成为最强大的神奇宝贝训练大师为目标,即将踏上修炼之旅。小智因为早上睡觉迟到,差点失去了挑选神奇宝贝的资格。
14年前,第一架飞机被怀疑是第一种神化形式的觉醒带来了近三次冲击,在世界上引发了前所未有的动荡。之后,前NERV成员,如葛成梅丽(三石琴配音)逃离并建立了Wille,Wille反抗Seele和NERV。