朋友妻子的美丽吸引了男主角，男主角的下半身竟然做出了反应。男主角的妻子也很高兴，觉得有希望治疗男主角的病，她决定牺牲，交换妻子来治愈男主角
武田面临再次入狱，将会长职务传给新生代松村保（北大路欣也 饰），元老人物大友胜利（穴户锭 饰）和早川英男（织本顺吉 饰）对武田一派摒弃极道的生活方式不以为然，联合广能的兄弟市冈辉吉（松方弘树 饰）谋取天政会统治权，但市冈遇刺，大友一派落败。 对腥风血雨感到厌倦的武田萌生退意，亦劝广能（菅原文太 饰）退出，但为市冈报仇心切的广能怎可罢休？另一方面，大友组复仇击杀天政会副理事长江田省一（山城新伍 饰），松村亦受重伤。伤重的松村念念不忘和平统一广岛的梦想……
茵蒂克丝自称因拥有十万三千本魔导书而被魔法师追杀，而上条当麻靠自己的超能力也认定了少女的魔法。少女以危险为由离开上条家，上条如往日一般去学校学习，但放学回家，却发现茵蒂克丝倒在血泊之中。在科学与魔术交叉的世界中，上条当麻与茵蒂克丝的故事开始了。
