在寒冷的北海道旭川市某处，生活着以美人自居的大小姐九条樱子（伊藤静 配音）。除了有些自恋外，樱子还有用死尸骨头制作标本的怪癖，其对于验尸更有着较深的学识。
巧合的是，在月影岛的村长选举期间，柯南和其他人开始询问，以找到来到侦探办公室的发件人。为了寻找线索并参观岛上的公民大厅，麻生太郎的朋友月影岛的前村长桂山逝世三周年的仪式即将开始。于是柯南和他的团队发现了一架有年龄的钢琴。那架钢琴被称为麻生太郎去世当天音乐会上演奏的“被诅咒的钢琴”，甚至导致前村长桂山死亡。然后，仪式期间播放了《月光》的旋律，村里最大的资产川岛的溺水尸体被发现了，川岛是村长候选人之一。虽然是在室内发现的，但川岛的尸体是湿的，他的夹克漂浮在面向公民大厅的海里。因此，据推测，川岛是在面向市民大厅的大海中溺水身亡，后来被送往市民大厅。据此，柯南推断，这封信是一封杀人通知，有可能发生下一次谋杀。第二天，当政府机构与木木警察局和我们部门的其他人进行法律诉讼时，公民大厅的38名村民进行了调查。然而，这一次在政府机构的广播室里，现任村长黑岩被暗杀了，甚至在市民大厅里发现了Masao青梅竹马西本的上吊尸体。
故事以高中女生佐仓千吉（小泽雅丽配音）的告白开始，她暗恋上了自己年级的一个男孩——身高1.9米、阳刚的野崎骏（中村裕一配音）。她忏悔的结果实际上是他的亲笔签名。
