这也是一个关于某个冬天的故事。山梨县的女高中生林志摩骑着她心爱的摩托车一路来到了汉明湖。从除夕开始，期待已久的单人露营。从山梨出发前往静冈县岩田。在岩田迎接新年，今天是第三天。尽管开了很长一段路，我还是感到很开心。
令我惊讶的是，一个名叫神山纱也的女孩（加藤英美里配音）的出现扰乱了两姐妹的日常生活。索发现Sakuya似乎和雪娜很亲近。索错误地认为两者之间有联系，但克制了自己内心的失落。索决定避开雪娜，为他们创造一些私人空间。就这样，一向形影不离的姐妹们逐渐疏远了。在这个过程中，薛奈终于体会到了自己对玩耍的深厚感情。经过一番波折，他们终于向对方表达了自己的意愿，幸福地生活在一起。
可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。 然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。 在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。 而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动…… 迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是——— 所有的答案，都在「Link Vrains」中
